Η αμφιλεγόμενη διάταξη για αυξήσεις 95% στους ιεράρχες δημιουργεί αφορμές επικρίσεων και σκανδαλισμού. Εγείρονται ερωτήματα για τον συγχρονισμό της απόφασης και τα κριτήρια της κυβέρνησης. Κύκλοι της αντιπολίτευσης κάνουν λόγο για εξυπηρέτηση πολιτικών σκοπιμοτήτων, ενώ εκκλησιαστικές πηγές τοποθετούνται υπέρ του «εξορθολογισμού» και της «θεσμικής εξομοίωσης».
Το θέμα προκάλεσε «εμφύλιο» και διαφωνίες εντός της Ιεράρχιας. Ορισμένοι Μητροπολίτες (όπως ο Κυθήρων Σεραφείμ) δήλωσαν ότι θα διαθέσουν τα επιπλέον χρήματα για κοινωφελείς σκοπούς, ενώ άλλοι (όπως ο Μεσσηνίας Χρυσόστομος) άσκησαν κριτική στον τρόπο που δόθηκαν οι αυξήσεις.